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Text File  |  1995-03-04  |  2.2 KB  |  42 lines
  1. ******************************************************************
  2. * Cys/Met metabolism enzymes pyridoxal-phosphate attachment site *
  3. ******************************************************************
  4.  
  5. A number   of  pyridoxal-dependent  enzymes  involved  in  the  metabolism  of
  6. cysteine, homocysteine and methionine have been shown [1,2] to be evolutionary
  7. related. These are:
  8.  
  9.  - Cystathionine   gamma-lyase   (EC 4.4.1.1)   (gamma-cystathionase),   which
  10.    catalyzes the  transformation  of cystathionine into cysteine, oxobutanoate
  11.    and ammonia. This is the final reaction in the transulfuration pathway that
  12.    leads from methionine to cysteine in eukaryotes.
  13.  - Cystathionine  gamma-synthase (EC 4.2.99.9), which catalyzes the conversion
  14.    of cysteine  and  succinyl-homoserine into cystathionine and succinate: the
  15.    first step  in  the  biosynthesis  of  methionine from cysteine in bacteria
  16.    (gene metB).
  17.  - Cystathionine beta-lyase (EC 4.4.1.8) (beta-cystathionase), which catalyzes
  18.    the conversion  of  cystathionine  into homocysteine, pyruvate and ammonia:
  19.    the second step in the biosynthesis of methionine from cysteine in bacteria
  20.    (gene metC).
  21.  - OAH/OAS sulfhydrylase, which  catalyzes  the conversion of acetylhomoserine
  22.    into homocysteine  and  that  of  acetylserine into cysteine (gene MET17 or
  23.    MET25 in yeast).
  24.  
  25. These enzymes are proteins of about  400 amino-acid residues.  The pyridoxal-P
  26. group is  attached to a lysine residue located in the central section of these
  27. enzymes; the  sequence around this residue is highly conserved and can be used
  28. as a signature pattern to detect this class of enzymes.
  29.  
  30. -Consensus pattern: D-[LIVM]-x(3)-[SAGC](2)-T-K-[YW]-[LIVM]-x-G-H-[SG]
  31.                     [K is the pyridoxal-P attachment site]
  32. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  33. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  34. -Last update: October 1993 / First entry.
  35.  
  36. [ 1] Ono B.I., Tanaka K., Naito K., Heike C., Shinoda S., Yamamoto S.,
  37.      Ohmori S., Oshima T., Toh-E A.
  38.      J. Bacteriol. 174:3339-3347(1992).
  39. [ 2] Barton A.B., Kaback D.B., Clark M.W., Keng T., Ouellette B.F.F.,
  40.      Storms R.K., Zeng B., Zhong W.W., Fortin N., Delaney S., Bussey H.
  41.      Yeast 9:363-369(1993).
  42.